大多數離心機事故都是由用戶錯誤造成的。1998 年，一起實驗室事故記錄在案，其中超速離心機由于高轉速的重力（g 力）引起的過度機械應力而失控。它摧毀了一臺離心機、一臺附近的冰箱、一臺超低溫冰箱、一個培養箱的控制系統，以及房間里所有的窗戶。報告顯示，實驗室人員使用了與離心機傳動軸不匹配的不兼容轉子。幸運的是，由于當時房間無人居住，因此沒有人員受傷報告。
如果用戶正確操作高速離心機，這些事故是可以避免的。
以下是操作離心機的一些重要指南。遵守這些程序可以減少損壞并最大限度地減少嚴重傷害的發生：
確保離心機轉筒和離心管干燥且主軸清潔。
不要使用與離心機制造商的轉子不匹配的轉子和附件。
使用前檢查樣品管是否存在裂縫、裂口或其他損壞。損壞時更換。
避免過度填充管子。
始終使用帶氣溶膠蓋的離心機安全杯來盛裝溢出物和潛在傳染性材料的氣溶膠。
確保轉子在傳動軸中正確且牢固地安裝。
不要超過轉子的最大運行速度。
不要讓離心機無人看管。等到離心機達到所需的速度/rcf 設置，并觀察任何異常噪音或過度振動，尤其是在系統啟動時。
運行期間關閉離心機蓋。
如果溢出，請在轉子停止后等待 10 分鐘，然后再打開蓋子。之后用 70% 乙醇或 10% 漂白劑溶液對離心機進行凈化。
只有經過適當培訓的人員才能檢查轉子上的 O 形圈。
確保離心機在使用后處于良好狀態。
安排定期預防性維護。
